Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms