Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms