Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms