Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms