Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms