Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM9SF4Q92544 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM9SF4Q92544 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms