Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms