Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC12Q8WUD4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms