Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf43Q8TAL5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms