Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms