Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms