Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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BEST3Q8N1M1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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