Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APTXQ7Z2E3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms