Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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