Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms