Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP100Q494V2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFAP100Q494V2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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