Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms