Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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HIST2H2BEQ16778 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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HIST2H2BEQ16778 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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HIST2H2BEQ16778 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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