Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ECM1Q16610 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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