Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF239Q16600 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF239Q16600 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF239Q16600 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF239Q16600 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF239Q16600 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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