Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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