Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms