Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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