Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN1Q14699 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms