Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIDRQ14159 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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