Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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