Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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