Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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