Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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