Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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