Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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RPA4Q13156 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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RPA4Q13156 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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RPA4Q13156 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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