Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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MRPL28Q13084 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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MRPL28Q13084 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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MRPL28Q13084 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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MRPL28Q13084 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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MRPL28Q13084 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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MRPL28Q13084 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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MRPL28Q13084 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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