Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLFN5Q08AF3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms