Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOS1Q07889 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOS1Q07889 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOS1Q07889 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOS1Q07889 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms