Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms