Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms