Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms