Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms