Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms