Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms