Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms