Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPCQ01831 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPCQ01831 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XPCQ01831 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms