Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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