Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms