Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms