Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN6P56747 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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