Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP4P49662 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms