Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms