Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC1P41238 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC1P41238 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC1P41238 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC1P41238 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms