Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms